VYBRAT REGION
Zavřít mapu

Software z Masarykovy univerzity poslouží výzkumu na Harvardu

Brno - Software vyvinutý odborníky z Masarykovy univerzity v Brně najde uplatnění na superpočítačích prestižní Harvardovy univerzity ve Spojených státech. Jde o vědecký program Caver, který slouží k pokročilé analýze a vizualizaci proteinových struktur.

6.4.2012
SDÍLEJ:

Ilustrační foto.Foto: DENÍK/David Taneček

Vznikl jako výsledek spolupráce brněnských přírodovědců a informatiků. O možnost využívat Caver nyní požádala Harvard Medical School, sdělila dnes mluvčí Masarykovy univerzity Tereza Fojtová. Škola připravuje také komerční uplatnění programu.

„Systém bude na Harvard Medical School sloužit přibližně 150 výzkumným laboratořím. Jsou to vědecké skupiny, které dělají velmi kvalitní výzkum, což dokládá užitečnost našeho programu. Jejich zájem o instalaci nás potěšil,“ uvedl v tiskové zprávě Jiří Damborský z Loschmidtových laboratoří Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.

Toxické látky

První verzi programu začali pracovníci Loschmidtových laboratoří vyvíjet ve spolupráci s Univerzitou Palackého v Olomouci v roce 2001, kdy zahájili práce na nové metodě odbourávání toxických látek v životním prostředí. Metoda spočívá v úpravě struktury enzymů technikami proteinového inženýrství.

Aby bylo možné úpravy provést, je nutné dobře poznat prostředí uvnitř proteinu. K tomu slouží systém Caver, jehož nejnovější verzi vytvořili biochemici ve spolupráci s Laboratoří interakcí člověka s počítačem, která působí na Fakultě informatiky Masarykovy univerzity.

„Předchozí verze uměly popsat dutinu v proteinu, ta nejnovější dokáže vyhodnocovat i její změny v čase, což je důležité, protože protein se neustále pohybuje,“ vysvětlil vedoucí laboratoře Jiří Sochor.

Po celém světě

Unikátní řešení, jež vědcům mimo jiné výrazně šetří čas, znají odborníci po celém světě. Univerzita jeho základní verzi nabízí ke stažení zdarma na internetu. Web Caver.cz má dnes asi 4000 registrovaných uživatelů, přičemž nejvíc jich pochází ze států s pokročilým výzkumem proteinů – Spojených států, Japonska, Německa, Indie a Velké Británie. Program přispěl i k několika objevům zveřejněným ve vědeckém časopise Nature.

Ohlas, který program mezi odborníky vyvolal, vedl k tomu, že univerzita začne systém nabízet i komerčně. Prostřednictvím firmy CaverSoft si mohou software s uživatelsky příjemným rozhraním zakoupit například farmaceutické nebo biotechnologické firmy. CaverSoft je takzvaná spin-off firma, jejímž cílem je proměnit duševní vlastnictví univerzity do podoby komerčně uplatnitelného produktu.

Autor: ČTK

6.4.2012 VSTUP DO DISKUSE
SDÍLEJ:

DOPORUČENÉ ČLÁNKY

Pavel Bělobrádek
3 7

Lidovci pokukují po premiérovi. Volí vedení

Ilustrační foto
9

Muslimské svátky? Turečtí vojáci se před sto lety dočkali i obětování beranů

Václav Klaus: Nešlo o vládní krizi, ale o zahájení volební kampaně

Bývalý český prezident Václav Klaus vidí podstatu koaličních hádek v tom, že poprvé zažíváme situaci, kdy jsou ve vládě dvě stejně silné strany. Ty se musejí proti sobě vymezit, aby jim volič uvěřil, že každá chce něco jiného. „Nic hrozivého se neděje, všechny instituce normálně fungují. Nešlo o vládní krizi, ale o bouřlivé zahájení volební kampaně," hodnotí události posledních dní.

Comeback na spadnutí? Kvitovou svádí Paříž

Stačilo zadat povel internetovému vyhledávači a spustila se lavina titulků v češtině, angličtině, francouzštině a určitě i v dalších jazycích. Články pod nimi se zabývaly tím, že jistá Češka odletěla do Paříže, přičemž se před odletem vyfotila a pochlubila se tím na instagramu.

FBI vyšetřuje kvůli „ruské kauze" i Trumpova zetě Kushnera

Federální úřad pro vyšetřování (FBI) se podle amerických médií zajímá o zetě a poradce Donalda Trumpa Jareda Kushnera. Důvod? Údajné ruské ovlivňování amerických prezidentských voleb.

Nechceme levné pracovní síly z východní Evropy, vzkazuje Macron

Emmanuel Macron, který se soustředil na evropskou integraci a kladl důraz na obnovení sil Evropské unie, chce omezit levné východoevropské pracovníky, kteří ohrožují francouzskou zaměstnanost, sociální výhody a daňové zatížení.

Copyright © VLTAVA LABE MEDIA a.s., 2005 - 2017, všechna práva vyhrazena.
Používáme informační servis ČTK. Kontakt na redakci.
Publikování nebo šíření obsahu Denik.cz je bez písemného souhlasu
VLTAVA LABE MEDIA a.s., zakázáno.
Marketingové podmínky. Cookies