VYBERTE SI REGION

Software z Masarykovy univerzity poslouží výzkumu na Harvardu

Brno - Software vyvinutý odborníky z Masarykovy univerzity v Brně najde uplatnění na superpočítačích prestižní Harvardovy univerzity ve Spojených státech. Jde o vědecký program Caver, který slouží k pokročilé analýze a vizualizaci proteinových struktur.

6.4.2012
SDÍLEJ:

Ilustrační foto.Foto: DENÍK/David Taneček

Vznikl jako výsledek spolupráce brněnských přírodovědců a informatiků. O možnost využívat Caver nyní požádala Harvard Medical School, sdělila dnes mluvčí Masarykovy univerzity Tereza Fojtová. Škola připravuje také komerční uplatnění programu.

„Systém bude na Harvard Medical School sloužit přibližně 150 výzkumným laboratořím. Jsou to vědecké skupiny, které dělají velmi kvalitní výzkum, což dokládá užitečnost našeho programu. Jejich zájem o instalaci nás potěšil,“ uvedl v tiskové zprávě Jiří Damborský z Loschmidtových laboratoří Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.

Toxické látky

První verzi programu začali pracovníci Loschmidtových laboratoří vyvíjet ve spolupráci s Univerzitou Palackého v Olomouci v roce 2001, kdy zahájili práce na nové metodě odbourávání toxických látek v životním prostředí. Metoda spočívá v úpravě struktury enzymů technikami proteinového inženýrství.

Aby bylo možné úpravy provést, je nutné dobře poznat prostředí uvnitř proteinu. K tomu slouží systém Caver, jehož nejnovější verzi vytvořili biochemici ve spolupráci s Laboratoří interakcí člověka s počítačem, která působí na Fakultě informatiky Masarykovy univerzity.

„Předchozí verze uměly popsat dutinu v proteinu, ta nejnovější dokáže vyhodnocovat i její změny v čase, což je důležité, protože protein se neustále pohybuje,“ vysvětlil vedoucí laboratoře Jiří Sochor.

Po celém světě

Unikátní řešení, jež vědcům mimo jiné výrazně šetří čas, znají odborníci po celém světě. Univerzita jeho základní verzi nabízí ke stažení zdarma na internetu. Web Caver.cz má dnes asi 4000 registrovaných uživatelů, přičemž nejvíc jich pochází ze států s pokročilým výzkumem proteinů – Spojených států, Japonska, Německa, Indie a Velké Británie. Program přispěl i k několika objevům zveřejněným ve vědeckém časopise Nature.

Ohlas, který program mezi odborníky vyvolal, vedl k tomu, že univerzita začne systém nabízet i komerčně. Prostřednictvím firmy CaverSoft si mohou software s uživatelsky příjemným rozhraním zakoupit například farmaceutické nebo biotechnologické firmy. CaverSoft je takzvaná spin-off firma, jejímž cílem je proměnit duševní vlastnictví univerzity do podoby komerčně uplatnitelného produktu.

Autor: ČTK

6.4.2012 VSTUP DO DISKUSE
SDÍLEJ:

DOPORUČENÉ ČLÁNKY

Politici nechápou, co je věda, jak funguje, říká nositel Nobelovy ceny za fyziku

Brno - Vědci se musí místo výzkumu věnovat papírování, kritizoval nositel Nobelovy ceny za fyziku Claude Cohen-Tannou-dji. „Moje děti se věnují vědě také a tráví šedesát procent času sepisováním zpráv," řekl ve čtvrtek fyzik publiku na VUT v Brně.

Taneční soutěž StarDance vyhrál Piškula před Bankem a Plodkovou

Praha - Vítězem osmé řady taneční soutěže StarDance se stal herec Zdeněk Piškula, který tančil s Veronikou Lálovou. Ve finále dnes předstihl lyžaře Ondřeje Banka s Evou Krejčířovou. Třetí skončila v diváckém hlasování herečka Jana Plodková s Michalem Padevětem. Odborná porota v přímém přenosu České televize ohodnotila stejným počtem bodů dnešní výkony Piškuly a Plodkové, Bank v tomto pořadí zůstal třetí.

Zaorálek míří do Turecka, jednat bude i o zadržených Češích

Ankara/Praha - Ministr zahraničí Lubomír Zaorálek odlétá v pondělí na dvoudenní návštěvu Turecka. Chce jednat o migrační krizi a podpořit vzájemné obchodní vztahy, bude se ale zabývat i případem dvojice Čechů, kteří byli v zemi zadrženi kvůli údajné příslušnosti ke kurdským milicím. Věnovat by se měl i problematickému projektu stavby turecké elektrárny Yunus Emre, na který poskytla úvěr Česká exportní banka (ČEB) a pojistila ho státní pojišťovna EGAP.

Copyright © VLTAVA LABE MEDIA a.s., 2005 - 2016, všechna práva vyhrazena.
Používáme informační servis ČTK. Kontakt na redakci.
Publikování nebo šíření obsahu Denik.cz je bez písemného souhlasu
VLTAVA LABE MEDIA a.s., zakázáno.
Marketingové podmínky. Cookies