V Jihlavě už Bokša působil jako hlavní kouč v sezoně 2006/07, kdy se tým marně pokoušel o návrat do nejvyšší soutěže. Trenérsky působil i v Chebu, LeRKu Brno, Drnovicích, Olomouci, Ostravě, Českých Budějovicích, Uherském Hradišti či Mladé Boleslavi.

Bokša má za úkol doplnit stávající kádr. Prioritou je dotažení návratu Adama Jánoše. Kromě toho chce vedení klubu posílit tým na místě levého obránce, brankáře a středního záložníka.