Majitel Zlatého míče z roku 1996 působil v bavorském velkoklubu od léta 2012. Letos v dubnu ho ale postihly problémy s prokrvováním mozku. Od té doby měl zdravotní pauzu a podle médií se stále necítí na návrat k práci.

Sammer ukončil hráčskou kariéru v létě 1997. O tři roky později zahájil trenérskou dráhu v Borussii Dortmund, pak vedl Stuttgart.