Podle dokumentu o sňatku, který web zveřejnil, si Phelps vzal bývalou Miss Kalifornie Nicole Johnsonovou 13. června v Paradise Valley v Arizoně. S Johnsonovou se jednatřicetiletý plavec zasnoubil loni v únoru a letos v květnu přivítali na svět syna, který dostal jméno Boomer. Jeho partnerka 13. června umístila na svůj účet na instagramu společnou civilní fotku se zmínkou o "památném večeru".

Phelps, který v Riu zakončil kariéru ziskem pěti zlatých a jedné stříbrné medaile, přitom během olympiády časopisu People říkal, jak se nemůže dočkat svatby. Mluvil o tom, že by se měla konat koncem roku. Phelps má celkem 28 olympijských medailí, z toho 23 zlatých, a suverénně vládne historickému pořadí.