Kritika Němečka souvisí s tím, že zaměstnanci ministerstva mohou podle serveru přijít o peníze na odměny a osobní ohodnocení, přestože na ně úřad má peníze přidělené ze státního rozpočtu. Odměňování pracovníků spadajících pod státní službu náleží do kompetence státního tajemníka.

"Personální situace na ministerstvu zdravotnictví je velmi tristní. Více než čtvrtina služebních míst není obsazena. Návrhy na navýšení složek platu v případě často klíčových zaměstnanců za účelem jejich udržení v úřadu šmahem odmítáte s argumentací, že na to nejsou prostředky. Ve výsledku se však ukázalo, že prostředky na platy v letošním roce nebudou dočerpány, a to v řádu milionů korun," cituje server z Němečkova vytýkacího dopisu.

Státního tajemníka jmenuje vláda na návrh příslušného ministra nebo vedoucího Úřadu vlády na dobu pěti let na základě výsledku výběrového řízení. Odvolat jej může opět jen vláda. Beneda byl jmenován loni v květnu, do té doby šéfoval personálnímu odboru ministerstva.