Vrchní soud v Praze potvrdil Zelenkovi doživotí, poslal ho do věznice se zvýšenou ostrahou. Doba strávená ve vazbě se mu nezapočítává do lhůty pro podmínečné propuštění, poprvé tak bude moci požádat o podmínečné propuštění v r. 2038. Soudce v rozsudku řekl, že jiný než doživotní trest nepřipadá v úvahu vzhledem k vysoké společenské nebezpečnosti jeho činu i motivu. "Od války česká justice podobný případ s tolika oběťmi nepamatuje," řekl soudce.

Podle vrchního soudu nejde o sedmnáct trestných činů tak jak to kvalifikoval soud v Hradci, ale pouze o jeden trestný čin vraždy na více osobách.

Obhájce navrhoval nové projednání

Obhájce Zelenky Jan Herout v závěrečné řeči soudu navrhl, aby vrchní soud celou kauzu vrátil zpět k novému projednání do Hradce Králové. Důvodem je, aby byli přibráni noví znalci z oboru hematologie a biochemie. Ti by se měli vyjádřit k přesné příčině úmrtí a poškození pacientů. Herout navrhuje, aby byl jeho klient odsouzen pouze za ublížení na zdraví s následkem smrti. Neuspěl, vrchní soud potvrdil doživotí.

Zelenkův obhájce také zpochybnil, že na seznam obětí patří všichni ti, kteří na něj byli napsáni, a za které byl Zelenka odsouzen.

Zelenkovo jednání? Jako dostihový sázkař

Obhájce soudu rovněž předložil oponentní znalecký posudek na duševní stav Petra Zelenky. Ten vypracovali znalci Maxmilián Kašparů a Josef Hádlík. Posudek ale v případu nepřinesl žádný zásadní zvrat, protože závěry znalců se shodují s tím, co konstatovali psychologové a psychiatři v Hradci Králové. To znamená, že i podle nich Zelenka netrpí žádnou duševní poruchou a jeho jednání přirovnali k dostihovému sázkaři. Ten také sází na své koně z důvodu vzrušení v průběhu celého dostihu a pokud jeho "kůň nevyhraje, ale zemře" tak nad tím pocítí určitou lítost, ale ta je vzápětí přehlušena dalším požitkem při sázení na nový dostih.

Obhájce Herout na základě těchto znaleckých posudků již nepožaduje, aby byl Zelenkův duševní stav vyšetřen ústavem nebo vysokou školou.

Otec Zelenky vyzval soudce k odvaze

Slovo u vrchního soudu dostal i otec Petra Zelenky Bohumil, který v emotivní řeči vyzval soudce k tomu, aby našel dost odvahy a celou kauzu vrátil zpět do Hradce Králové: "Chci znát skutečnou pravdu. Neříkám že je Petr nevinen, ale nevěřím, že udělal vše, co je mu kladeno za vinu."

Otec Zelenka v emotivní řeči také kritizoval práci policie, soudu a soudních znalců. Svého syna přirovnal k pyromanovi, který chtěl mít akci. Soudce jeho řeči bedlivě naslouchal, v jednom případě ho napomenul, aby mluvil k věci. K soudu přišlo i několik příbuzných obětí Petra Zelenky. Ti při řeči Bohumila Zelenky kroutili hlavami.

Bohumil Zelenka se odvolal na Julínkovu ministerskou komisi, která zjistila mnoho pochybení lékařů. Státní zástupkyně to ale odmítla s tím, že závěry komise korespondují se zjištěním znalců. Tedy, že neoprávněné podávání heparinu Zelenkou je připravilo o život. Bohumil Zelenka takzvaný Longinův seznam obětí rozdělil na tři skupiny.

1. Ti, kterým Zelenka heparin opravdu píchl. Podle přiznání Zelenky by jich mělo být pět.
2. Ti, kteří zemřeli kvůli svým vážným onemocněním
3. Na ty, které na seznam přihodili lékaři, aby tím maskovali svá pochybení.

Státní zástupkyně chce doživotí

Státní zástupkyně ve svém závěrečném návrhu požaduje pro Zelenku stejný trest, který mu byl vyměřen v Hradci Králové, tedy doživotí, a upozorňuje na to, že Zelenka se ke svým činům třikrát doznal.

"Doživotí je jediný možný trest vzhledem k jeho motivu provedení a postavení Zelenky jako zdravotníka. Činy navíc spáchal ze zvlášť zavrženíhodné pohnutky, kdy byli pacienti ve stavu bezmocnosti."

Zelenka se znovu omluvil

Závěrečné slovo dostal samotný Zelenka, který soudu řekl, že nikdy nechtěl nikomu ublížit ani nikoho usmrtit. Znovu se omluvil všem rodinám za své chování. "Nikdy jsem nechtěl vzít nikomu život, nikdy jsem nechtěl vykolejit lékaře ani jim dělat naschvály. Přijmu jakýkoli spravedlivý trest, ale nemůžu souhlasit se závěry znalce Pleskota, jehož posudek je zavádějící."

Případ byl odročen na jednu hodinu odpoledne, kdy soud potvrdil trest doživotí.

Vypadal podlomeně, byl bledý a pohublejší
Petr Zelenka seděl před začátkem hlavního líčení na lavici obžalovaných s pouty na rukou. Soudce mu je pak ale nechal sundat. Dvaatřicetiletý Zelenka vypadal proti procesu v Hradci Králové dost podlomeně. V obličeji byl bledý a pohublejší. Celou dobu seděl takřka nehnutě s kamenným výrazem v obličeji. Občas si utřel nos, ale jinak na sobě nedal znát žádné emoce. Když byl soudcem vyzván, aby pronesl závěřečnou řeč, k ohrádce se doslova dopotácel. Chvílemi i vrávoral. Působil dojmem, jako kdyby byl pod vlivem nějakých tlumících prášků. Sám Zelenka soudci řekl, že se necítil nato, aby do soudní síně přišel. „Pak jsem si ale řekl, že to dotáhnu do konce,“ poznamenal Petr Zelenka.