Nejsledovanějším bodem v současných česko-amerických vztazích jsou úvahy o možném vybudování protiraketového deštníku v Česku a Polsku. Česká vláda již souhlasila se zahájením vyjednáváním o stavbě radaru ve vojenském prostoru Brdy, konečné rozhodnutí ale nepadlo.

Mezi zásadní témata patří rovněž dlouholeté české úsilí o zrušení vízové povinnosti vůči českým občanům. Česká republika je v čele koalice zemí usilujících o bezvízový styk; v americkém Kongresu byl již předložen návrh na rozšíření bezvízového režimu.